Jmol - Visualização De Modelos Moleculares
O Jmol constitui um programa de código-fonte e
distribuição livres para representação de modelos moleculares
tridimensionais, sendo oferecido sob a licença GLPL (GNU Lesser General
Public License). O Jmol permite uma diversidade de renderizações
cromáticas, movimentos de translação e rotação das moléculas, ampliação
visual, cálculos de distância, ângulos, estruturas e superfícies,
otimizações moleculares, e animações, dentre outros.
O programa é multiplataforma (Windows, Mac
OS X, Linux, Unix) elaborado em ambiente Java, e pode ser executado
tanto em versão fechada (standalone), como integrado a outras aplicações
em Java, ou ainda junto a buscadores de internet por auxílio de um
applet. Quando instalado, Jmol pode rodar tanto a
partir de uma pasta de diretório contendo seus arquivos, como a partir
de um disco rígido ou mídia removível (pendrive).
Complementarmente, o acesso ao
Jmol pode ser realizado pela internete, sem a necessidade de
arquivos no computador. Dentre os diversos sites que possuem o
applet JSmol que permite esse acesso, sugerimos o link
abaixo, adaptado do applet desenvolvido pelo St. Olaf
College:
Material Online Para Estudo de Biomoléculas Com JSmol
Os links abaixo possibilitam experimentar
um material em construção totalmente online (programa e
modelos) para aprendizado em Bioquímica com uso do JSmol,
um applet do Jmol que não requer instalação local do
programa. Este material foi adaptado e portabilizado a partir do
ebook Bioquímica Estrutural
Guiada Por Jmol (Editora Unifal-MG, 2019, ISBN 978-85-63473-42-4).
De modo geral, seu conteúdo possibilita auxiliar no aprendizado autônomo
das principais estruturas moleculares em Bioquímica, pelo
acompanhamento progressivo dos temas tratados com auxílio do
visualizador.
Material Offline (ebook e modelos)
Também encontra-se disponível os conteúdos
desenvolvidos com Jmol para Bioquímica e temas
afins visualizados neste ebook
autoral.
Os modelos contidos no
ebook são obtidos neste LINK,
separados por capítulos do ebook, ou em aquivo único comprimido (zip), contendo
as imagens renderizáveis. As figuras são abertas em qualquer
visualizador de imagens de forma estática, ou tridimensionalmente e de
forma dinâmica pelo Jmol.